Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms