Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtswP56203 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtswP56203 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms