Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NcanP55066 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NcanP55066 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NcanP55066 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NcanP55066 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NcanP55066 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NcanP55066 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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