Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad23bP54728 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms