Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod1P49813 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod1P49813 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms