Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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