Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms