Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms