Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lig1P37913 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms