Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rfc1P35601 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rfc1P35601 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rfc1P35601 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc1P35601 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc1P35601 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rfc1P35601 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rfc1P35601 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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