Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms