Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp13P33435 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mmp13P33435 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms