Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cd28P31041 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cd28P31041 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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