Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprmP28828 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms