Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Hoxd10P28359 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Hoxd10P28359 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms