Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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