Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col8a2P25318 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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