Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NdnP25233 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms