Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfyaP23708 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms