Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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