Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3aP23116 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms