Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcaP20444 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms