Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ntf3P20181 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms