Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P20040 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P20040 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P20040 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
P20040 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
P20040 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P20040 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P20040 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P20040 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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