Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18533 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18533 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms