Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18530 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18530 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms