Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18528 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18528 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms