Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms