Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Myod1P10085 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Myod1P10085 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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