Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms