Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxd3P09027 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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