Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Spta1P08032 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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