Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CfdP03953 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
CfdP03953 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CfdP03953 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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