Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01649 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01649 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms