Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms