Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops6O88545 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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