Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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