Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Edil3O35474 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms