Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casq1O09165 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Casq1O09165 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casq1O09165 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Casq1O09165 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Casq1O09165 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Casq1O09165 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Casq1O09165 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casq1O09165 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Casq1O09165 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casq1O09165 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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