Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MttpO08601 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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MttpO08601 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MttpO08601 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MttpO08601 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MttpO08601 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MttpO08601 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MttpO08601 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MttpO08601 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms