Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MsmbO08540 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms