Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp35M0QWN7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms