Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8356J3QPD3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms