Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm20795J3QP49 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm20795J3QP49 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20795J3QP49 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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