Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34c3J3QJW5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms