Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r58G3X9U3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms