Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nccrp1G3X9C2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms