Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms