Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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