Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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